Sind die Fenster immer schon erzeugt und nur nicht sichtbar? -> Erzeugung der Formulare erst wenn sie benötigt werden und freigabe wenn Sie nicht mehr benötigt werden, ansonsten belegen sie schon unnötigerweise
GDI-Ressourcen.
Langandauernde Aktionen sollten wenn möglich in Thread verlagert werden. Falls das zu aufwending ist sollte regelmäßig die Message-Schleife des Programms bedient werden. Am einfachsten durch ein Application.ProcessMessage. Man sollte aber dafür sorgen das der User dann nicht versehentlich einen Button drückt und dann eine "parallele" Verarbeitung startet.