Muß es unbedingt eine Live-Kontrolle sein?
Dateisystem überwachen und nach dem Speichern/Verändern der Datei wird diese gehasht und die Prüfsumme gespeichert.
Beim Anstecken des USB-Sticks dann das Programm mit starten und die/alle Dateien auf dem Stick prüfen.
Das dürfte auch ohne Adminrechte funktionieren.
Ansonsten eben der Dateisystemfilter oder in alle Programme Hooks einschleußen, welche die Dateizugriffe auf den Stick abfangen.
Oder man richtet ein virtuelles Laufwerk/Verzeichnis ein, so ala TrueCrypt oder der Zip-Explorer-Erweiterung in XP/Vista/7, aber dafür benötigt man bestimmt ebenfalls gewisse Rechte.
[edit] "Rohos Mini Drive" ... hmmm, oder es geht auch ohne zusätzliche Rechte