Wenn das Fremdprogramm explizit den Internet Explorer (iexplore.exe) aufruft, gibt es wenig was man dagegen tun kann.
Letzte Rettung wäre das Fremdprogramm zu patchen und den String "iexplore.exe" durch "firefox.exe"#0 (das #0 soll darauf hindeuten, dass es nötig ist den String am Ende mit einer Hex-0 zu überschreiben) zu ersetzen.
Zum Ändern der Fremdanwendung eignet sich z.B. der hervorragende
HxD.