Das wird extra als nichtzuversteuerndes Einkommen ausgewiesen, also ich hab auf meinem Lohnzettel 2 Posten, 1x Fahrkostenzuschuss und 1x Lohn. Also kommen die 90€ zum Nettolohn dazu.
Die 90€ musst Du Dir dann anschliessend vom Finanzamt wieder anrechnen lassen, da es vom Arbeitgeber übernommen wird. Also musst Du beim Freibetrag diese noch berücksichtigen, damit Du nachher nicht eine dicke Nachzahlung leisten musst. Somit ergäben sich rechnerisch 375-90 = 280€/Monat als Freibetrag. Obwohl ich ebenfalls nicht genau weiß, ob das vor der Deckelung oder nachher abgezogen wird. Einfach mal beim Finanzamt anrufen und fragen!
Das Geld bekommst Du in jedem Fall vom Finanzamt wieder, wenn Du eine Steuererklärung machst. Mit Freibetrag bist Du dazu sogar verpflichtet eine abzugeben. Jetzt ist nur die Frage wie man seine Präferenzen setzt. Einmal im Jahr eine dicke Rückzahlung vom FA oder monatlich einen kleinen Teil mehr netto, welcher "sowieso" versandet, wenn man ihn nicht wegspart. Ich habe meinen Freibetrag niedriger eintragen lassen, also eine Mischung aus beidem. Und bewahrt noch vor bösen Überraschungen, wenn die mir irgendwas streichen.