So wie das auf dem Screenshot aussieht, wird im 3D-Fenster ja nur angezeigt, welche LED's gerade aktiv sind und welche Farbe sie haben.
Eigentlich müsste man dafür nur mit
OpenGL ein paar Cubes entsprechend der Matrix zeichnen und die dementsprechende Diffuse-Color auf den Cube setzen.
Für sowas kannste z.B. der Einfachheit halber auch GLScene nehmen, auf Performance kommt es da ja nicht wirklich an