Base64 bedeutet nur, daß "es auf Basis von 64 Zeichen" kodiert ist.
Der Zeichensatz ist dabei grundsätzlich egal.
Bei "guten" Funktionen/Klassen, welche nach Base64 umkodieren, kann man den Zeichensatz angeben.
Allerdings hast du ja nicht gesagt, was du derzeit dafür nutzt.