Wenn du es ganz simpel haben willst, dann leg doch für deine "Lizenz-Informationen" einen Key in
HKCU\Software\ an, eventuell eben einen zusätzlichen zweiten zu deinen "normalen" Programm-Keys mit einem ganz anderen Namen.
Das ist zwar jetzt nicht die feinste englische Art und ein guter Schutz ist es auch keineswegs, aber eine simple Art und Weise.
Andere Root-Keys würde ich nicht nehmen, Software-Settings gehören in
HKCU\Software und nicht irgendwo anders hin, wo sie das User-System vermüllen
