Diese Änderung selber führt der Server durch, obwohl ich sowas eigentlich eher von
FTP kenn, als von
HTML ... wenn da eine Datei im "Textmodus" versendet/empfangen wird, dann ließt der Server diese Datei Zeilenweise aus und fügt seine eigenen Zeilenumbrüche wieder ein.
Hast du mal nachgesehn, ob die Dateien auch wirklich mit deinem Windows-Zeilenumbruch hochgeladen wurden?